《柑橘味香气》讲述了女高中生柚子因父亲再婚，进入到新家庭，并转入到一所女子高中就读。在这所校规森严的学校里，柚子遇到了外表冷酷但内心温柔的学生会长葵。葵起初对柚子的行为多有不满，两人冲突不断。然而，在相处过程中，柚子的活泼开朗逐渐打动了葵，葵也展现出自己不为人知的一面，两人的关系开始发生微妙的变化。她们一起经历了校园生活中的种种事件，包括处理学生会事务、面对同学的误解等。在这个过程中，她们的感情不断升温，最终勇敢地面对自己的内心，接受了这份特殊的情感。尽管在这个过程中她们面临着来自学校、家庭和社会的压力，但她们相互扶持，共同成长，最终收获了属于自己的幸福结局。
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